机械设备日常使用都是需要清洁维护，冷冻干燥机也不例外。如果冷冻干燥机在使用的过程当中有操作不当产生压损，这也不是什么难点，事先就可以去避免这个问题。
冷冻干燥机的螺杆空压机主机及电机放置在高弹防震架上，有效降低共振与低频噪音传导，采用高效开孔式阻燃型聚氨酯吸音棉，对电机和主机噪音有超强吸收能力。双风道设计更大程度使噪音阻隔在设备内部，有效地降低空压机的整体噪音。
冷冻干燥机的运转部件需要经常维护、清洗：
1、对各运转部件进行清洗，紧固等保养工作，必须在停机后进行；
2、禁止用汽油或煤油清洗空压机的滤清器、气缸和其它压缩空气管路的零件，以防火灾和爆炸。不得用燃烧方法清除管道油污；
3、用柴油或汽油清洗机件时，严禁吸烟，附近不得有火种，用过的废油、破布、棉纱要妥善处理，不得乱扔、乱泼；
4、空气压缩机的空气滤清器须经常清洗，保持畅通，以减少不必要的动力损失；
5、空气压缩机若用于喷砂除锈等灰尘较大的工作时，应使机械与喷砂场地保持一定距离，并应采取相应的防尘措施。